Сериал «Канцелярская крыса» рассказывает историю майора Андрея Вершинина, чья спокойная служба в полицейском архиве неожиданно заканчивается. Его переводят в беспокойный приграничный городок Портовый и назначают на пост начальника УВД, который опустел после гибели прежнего руководителя.

На новом месте Вершинина ждет откровенно холодный прием. Коллеги-оперативники видят в нем лишь бумажного работника, неспособного к реальной работе, а местные жители и журналисты, напуганные чередой дерзких ограблений, открыто возмущены его назначением. Давление нарастает со всех сторон, превращая каждый рабочий день в испытание на прочность.

Теперь Андрею приходится доказывать свой профессионализм не на словах, а в деле. Ему предстоит разобраться в хитросплетениях местных интересов, найти общий язык с подчиненными и, самое главное, выйти на след преступников. Все это он должен сделать в одиночку, опираясь лишь на собственные принципы и умение видеть то, что другие давно перестали замечать.